南京中醫(yī)藥大學中醫(yī)藥信息學學科，是中醫(yī)藥學與信息技術融合而成的交叉學科，歷經30多年的發(fā)展和積累，在科學研究、師資和教材建設、國內外交流合作、人才培養(yǎng)、與臨床和生產實踐相結合等方面都走在國內中醫(yī)藥院校的前列。2012年被批準為國家中醫(yī)藥管理局重點學科。
1 歷史輝煌
本學科依托南京中醫(yī)藥大學中醫(yī)藥文獻研究所及南京中醫(yī)藥大學信息技術學院為學科基地。
中醫(yī)藥文獻研究所是國家級重點學科所在單位，是國內外中醫(yī)藥文獻整理及信息研究的重鎮(zhèn)，豐富的標志性工作成果，為開展中醫(yī)藥信息化工作奠定了堅實的基礎。
信息技術學院是國內中醫(yī)藥高等院校中較早成立的信息技術教育與研究機構，上世紀80年代起致力于中醫(yī)專家系統(tǒng)及中醫(yī)脈象客觀化方面的研究。中醫(yī)文獻信息學建設起步早，理念新。在國內最早開發(fā)、研制中醫(yī)專家診療軟件系統(tǒng)；最早開發(fā)、研制中醫(yī)藥學科數(shù)據(jù)庫、知識庫。
2 團隊卓越
本學科的學科帶頭人為虞舜研究員，第一學術帶頭人為王旭東教授，第一后備學科帶頭人為胡孔法教授。成員涵蓋中醫(yī)藥學、計算機科學與技術、信息管理、數(shù)學、應用物理學，組成三個團隊：⑴中醫(yī)藥文獻信息化處理研究學術方向,帶頭人為虞舜研究員；⑵中醫(yī)藥臨床與教學信息傳播與信息系統(tǒng)的關鍵技術研究學術方向，帶頭人為龔慶悅副教授；⑶中醫(yī)藥信息工程及人工智能的關鍵技術研究學術方向，帶頭人為周金海教授。學術團隊繼承了前輩學者艱苦奮斗、開拓創(chuàng)新的優(yōu)良傳統(tǒng)，長期合作，取得了一系列中醫(yī)信息學研究的優(yōu)秀成果
3 成果豐碩
教學方面，本學科在中醫(yī)藥信息相關教材的建設中取得豐碩的成果，主編4種、副主編5種，編委5種，在國內同行中居于領先地位，由本學科教師編寫的《醫(yī)院信息系統(tǒng)教程》、《實用醫(yī)學信息學》和《醫(yī)學信息學》等教材被全國中醫(yī)藥院校廣泛采用。本學科在培養(yǎng)中醫(yī)藥信息復合型人才方面起步早，課程設置合理，教學成果顯著，學生不僅精通計算機技術，也熟知中醫(yī)藥領域的相關知識，在第11屆、第12屆“挑戰(zhàn)杯”全國大學生課外學術科技作品競賽中分別獲得三等獎、二等獎。
在科研方面，本學科有較好的國內、國際知名度，2007年以來承擔了國家級33項、部省級34項、本單位24項研究項目的科研工作，各個學術方向獲得穩(wěn)定的支撐，并和國內多個國家重點學科、南京海泰醫(yī)療信息系統(tǒng)有限公司、南京朗坤軟件有限公司、南京海昌中藥集團、南京商友資訊電子商務應用研究所、無錫市明山醫(yī)用軟件工作室、常熟市明達科技發(fā)展有限責任公司、江蘇先聲藥業(yè)有限公司、江蘇康緣藥業(yè)、蘇州醫(yī)療用品廠有限公司、蘇中藥業(yè)集團股份有限公司、江蘇省中醫(yī)院、江蘇省中西醫(yī)結合醫(yī)院等單位有中醫(yī)信息學合作成果；與聯(lián)合國大學國際軟件研究所、美國德州大學醫(yī)學信息學院、新加坡國立大學等多個國際知名醫(yī)學信息學研究基地有包括中醫(yī)藥遠程診療系統(tǒng)、中醫(yī)電子病歷、中醫(yī)藥知識的推廣和傳播、3D動畫等多個領域的合作，并應聯(lián)合國國際衛(wèi)生研究所等單位邀請，代表我國參與第三世界國家醫(yī)學信息學研究生培養(yǎng)方案的制定。