計算機學(xué)系于2024年5月學(xué)院內(nèi)設(shè)機構(gòu)調(diào)整時成立，前身為計算機科學(xué)與技術(shù)教研室，下設(shè)計算機科學(xué)與技術(shù)專業(yè)。計算機科學(xué)與技術(shù)專業(yè)2003年招生，是學(xué)院最早設(shè)立的專業(yè)，現(xiàn)為國家一流本科專業(yè)建設(shè)點、校重點專業(yè)和重點學(xué)科，先后入選江蘇省品牌專業(yè)二期和三期建設(shè)工程、江蘇省卓越工程師教育培養(yǎng)計劃2.0專業(yè)。學(xué)系主要參與建設(shè)江蘇省智慧中醫(yī)藥健康服務(wù)工程研究中心、唐仲英基金會中醫(yī)疫病研究中心、醫(yī)藥信息技術(shù)實踐教育中心等省級平臺，為教師科研和學(xué)生創(chuàng)新實踐提供平臺支持。
學(xué)系擁有一支具有計算機、軟件工程、人工智能、中醫(yī)藥等交叉學(xué)科背景的高水平師資隊伍，聚焦“智能+中醫(yī)藥”交叉學(xué)科領(lǐng)域研究。專任教師中高級職稱比例45%，博士學(xué)位比例82%，江蘇省教學(xué)名師1人，入選省有突出貢獻(xiàn)中青年專家、省“青藍(lán)工程”創(chuàng)新團(tuán)隊帶頭人、省“333工程”、省“六大人才高峰”、科技副總等省級人才工程10多人次。近5年，專任教師主持國家自然科學(xué)基金、國家重點研發(fā)計劃子課題等國家級項目10余項，獲省部級科技獎勵10余項。
學(xué)系堅持“學(xué)生中心、產(chǎn)出導(dǎo)向、持續(xù)改進(jìn)”的教學(xué)理念，注重學(xué)生解決復(fù)雜工程問題能力的培養(yǎng)。通過科研反哺教學(xué)、本科生導(dǎo)師制、學(xué)賽結(jié)合等舉措，加強學(xué)生實踐能力培養(yǎng)和創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)教育。近五年，學(xué)生獲“互聯(lián)網(wǎng)+”、挑戰(zhàn)杯、數(shù)學(xué)建模、計算機設(shè)計大賽等學(xué)科競賽國家級獎項40余項、省級獎項100余項，立項國家級大學(xué)生創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)訓(xùn)練項目10多項，在全國中醫(yī)藥院校中起到很好的示范引領(lǐng)作用。